Ви не увійшли.
Как я понял, вы хотите с одного компа управлять мышью другого. Для этого возьмите Arduino Due. На один USB подключите Мастер. На другом эмулируте как мышь. К мастеру подключайтесь по UARTу.
Спасибо! Буду копать 
день добрый, есть много готовых решений, например на базе stm32

http://www.stm32circle.com/projects/project.php?id=17
этот пример когда то проверял
управляющие команды по UART сделал бы. 
т.е. с 2 аппаратными  USB я бы не заморачивался.  
любой производитель MCU с аппаратным  USB device сделал пример ( USB HID ) мышки   либо кто то уже позаботился  пример выложить.  тут уже Ваши предпочтения  по производителю и среде разработки.
 либо кто то уже позаботился  пример выложить.  тут уже Ваши предпочтения  по производителю и среде разработки. 
Кто то Atmel  предпочитает, кто то ST, TI и т.д.
лично я взял бы за основу STM32F103 или что то покруче, задел на будущее 
Добрый вечер. Подскажите пожалуйста что лучше выбрать для реализации следующего проекта:
- контроллер подключается по юсб к двум компьютерам - мастер и слейв 
- слейв видит устройство как мышь 
- мастер передает контроллеру список команд, которые нужно эмулировать - команды вополняются в реальном времени (движение мыши, клик левой/правой кнопкой)
Поиски на данный момент принесли два варианта:
1) 2 ардуино соединенные между собой по уарту - один получает команды от мастера, другой выдает себя за мышь для слейва (какие лучше использовать для этих задач?)
2) Arduino Due з двумя юзб чтобы подключить сразу и мастера и слейва. 
Может есть какой-то 3й, 4й.. варианты.
Спасибо за любую помощь.